電腦系統環境下的應用控制指的是內部控制結構中之會計系統和控制程序。設計這些控制之目的在於任何特定的應用作業，例如薪資處理、銷售訂單等，電腦系統已適當地將資料加以記錄、處理及報告。應用控制以功能分類計有(1)輸入控制(Input Controls)、(2)處理控制(Processing Controls)、(3)輸出控制(Output Controls)(林柄滄，2002；吳琮璠，2005)。
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